A pesquisa desempenha papel fundamental na consolidação da faculdade como espaço para a produção e disseminação do conhecimento.  Como elementos indissociáveis o ensino, pesquisa e extensão constituem os três pilares básicos do ensino universitário de qualidade voltado para a formação de indivíduos conscientes do seu papel de agentes transformadores da sociedade. A necessidade de incentivar o trabalho de pesquisa e investigação científica, e de institucionalização da produção intelectual, determinada pela Lei de Diretrizes e Bases (LDB, cap. IV, art. 43 - III; art. 52 - I), estabelece novas políticas a serem adotadas pelas universidades brasileiras. A Faculdade Santo Antônio incentiva a produção científica e motiva as iniciativas voltadas para comunidade tendo como foco principal a melhoria na qualidade de vida.

A pesquisa, da forma como se propõe, está vinculada a quinze Linhas de Pesquisa Institucional da Faculdade Santo Antônio, instituídos pelo CONSEPE, em 20 de junho de 2008. A finalidade de sua elaboração foi no sentido de auxiliar a organizar, articular e fazer avançar a pesquisa institucional, tendo em vista o cumprimento da missão da Santo Antônio. A ação de pesquisa desencadeada e organizada a partir destas Linhas de Pesquisas deverá considerar, para todas eles, sem exceção, que o motivo de todas as atividades, em consonância com a presente descrição da missão da Santo Antônio, é " Educar e formar cidadãos conscientes de sua responsabilidade com os valores éticos, culturais e profissionais, visando satisfazer as principais demandas sociais com a eficácia exigida pelo mundo contemporâneo (Projeto Pedagógico - Gestão 2005-2008).

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